消毒供应中心位于住院部三楼， 承担全院各科室所有可重复使用诊疗物、器械、器具、手术器材和外来器械等物品清洗、消毒、灭菌以及无菌物品供应。所有器械物品均采用高压蒸汽灭菌、环氧乙烷低温灭菌及过氧化氢低温等离子三种方式消毒灭菌，并实行下收下送，每年工作量以 10% 速度递增。
  消毒供应中心是湘西州消毒供应质控中心挂靠单位，湖南省消毒供应质控中心委员单位，湖南省消毒供应中心专业委员会委员单位，同时也是国家卫生健康委全国消毒供应质控管理与控制平台哨点医院。